Muzeum dokumentuje wielowiekową historię miasta – od średniowiecza po czasy współczesne. Jego główna siedziba mieści się w Ratuszu Głównego Miasta, dawnej siedzibie władz miejskich z XIV wieku, przekazanej muzeum w 1970 roku.
Zbiory liczą około 50 tysięcy obiektów, a całą instytucję tworzy 10 oddziałów, w tym m.in. Dwór Artusa, Dom Uphagena, Twierdza Wisłoujście, Muzeum Bursztynu oraz Wartownia nr 1 na Westerplatte. Część oddziałów działa przez cały rok, a część sezonowo.
Muzeum organizuje wystawy stałe i czasowe, wydarzenia edukacyjne, koncerty oraz projekty popularyzujące historię Gdańska.
Dzieje miasta, kultura, architektura i codzienne życie na przestrzeni wieków

